Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lgr6Q3UVD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lgr6Q3UVD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms