Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr1d1Q3UV55 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr1d1Q3UV55 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms