Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prom2Q3UUY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prom2Q3UUY6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms