Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B3gnt6Q3USF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B3gnt6Q3USF0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms