Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf48Q3US17 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf48Q3US17 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf48Q3US17 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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