Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309.5 ms