Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin1rt1Q3ULQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin1rt1Q3ULQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin1rt1Q3ULQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin1rt1Q3ULQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms