Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp19Q3UJD6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp19Q3UJD6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms