Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edc4Q3UJB9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Edc4Q3UJB9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.6 ms