Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zswim8Q3UHH1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zswim8Q3UHH1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms