Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef3Q3UGY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgef3Q3UGY8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arfgef3Q3UGY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms