Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rrp36Q3UFY0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp36Q3UFY0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms