Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zyg11bQ3UFS0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zyg11bQ3UFS0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zyg11bQ3UFS0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms