Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cops9Q3U898 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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