Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vars2Q3U2A8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms