Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brms1lQ3U1T3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1lQ3U1T3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms