Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D0

Lins1, Protein Lines homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lins1Q3U1D0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lins1Q3U1D0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lins1Q3U1D0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lins1Q3U1D0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms