Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ankrd33bQ3U0L2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd33bQ3U0L2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms