Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem88bQ3TYP4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem88bQ3TYP4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms