Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc27Q3TKY6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc27Q3TKY6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc27Q3TKY6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc27Q3TKY6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc27Q3TKY6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc27Q3TKY6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc27Q3TKY6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc27Q3TKY6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms