Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdlim7Q3TJD7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms