Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp39Q3TIX9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp39Q3TIX9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms