Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RubcnlQ3TD16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RubcnlQ3TD16 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnlQ3TD16 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms