Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M3Q31093 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M3Q31093 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M3Q31093 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms