Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm1123Q1RME4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm1123Q1RME4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms