Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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