Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc162pQ0VG85 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms