Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930480E11RikQ0VG34 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930480E11RikQ0VG34 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms