Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim24Q0VG18 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim24Q0VG18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim24Q0VG18 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms