Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne7Q0VE82 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms