Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rundc1Q0VDN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rundc1Q0VDN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms