Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntnap5bQ0V8T8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntnap5bQ0V8T8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms