Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab42Q0PD08 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab42Q0PD08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms