Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SobpQ0P5V2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SobpQ0P5V2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SobpQ0P5V2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms