Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kndc1Q0KK55 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kndc1Q0KK55 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kndc1Q0KK55 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms