Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnnm1Q0GA42 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnnm1Q0GA42 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnnm1Q0GA42 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms