Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff1Q08423 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tff1Q08423 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms