Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata4Q08369 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms