Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm3Q08189 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm3Q08189 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm3Q08189 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms