Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp2Q06649 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms