Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrx2Q06348 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms