Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Thbs3Q05895 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thbs3Q05895 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms