Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdk16Q04735 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk16Q04735 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk16Q04735 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms