Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tff2Q03404 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tff2Q03404 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms