Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msx2Q03358 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msx2Q03358 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms