Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hivep1Q03172 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hivep1Q03172 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms