Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mark3Q03141 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mark3Q03141 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mark3Q03141 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mark3Q03141 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mark3Q03141 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms