Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacna1sQ02789 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1sQ02789 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1sQ02789 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms