Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GscQ02591 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GscQ02591 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GscQ02591 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GscQ02591 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GscQ02591 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GscQ02591 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GscQ02591 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GscQ02591 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GscQ02591 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GscQ02591 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GscQ02591 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GscQ02591 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GscQ02591 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GscQ02591 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GscQ02591 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GscQ02591 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GscQ02591 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GscQ02591 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GscQ02591 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GscQ02591 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GscQ02591 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GscQ02591 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GscQ02591 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GscQ02591 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GscQ02591 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GscQ02591 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GscQ02591 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GscQ02591 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GscQ02591 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GscQ02591 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms