Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Muc1Q02496 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Muc1Q02496 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms